Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODC1P11926 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms