Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms