Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS6O14544 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS6O14544 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS6O14544 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms