Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms