Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms