Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms