Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ABI3Q9P2A4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms