Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms