Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAF1Q9H7N4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAF1Q9H7N4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms