Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms