Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRIP1Q9BX63 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms