Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIOK2Q9BVS4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms