Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RABGGTAQ92696 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RABGGTAQ92696 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RABGGTAQ92696 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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