Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms