Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms