Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms