Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSMPQ1L6U9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms