Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCK2Q16822 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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