Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms