Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms