Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
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SHROOM2Q13796 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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SHROOM2Q13796 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
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