Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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FOXC1Q12948 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXC1Q12948 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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