Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms