Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms