Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSG4Q00888 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms