Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms