Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms