Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NESP48681 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NESP48681 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NESP48681 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NESP48681 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NESP48681 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms