Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPS1P31327 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPS1P31327 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPS1P31327 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms