Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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