Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGAMP11215 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGAMP11215 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms