Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms