Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMDSO60547 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms