Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRTM2O43300 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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