Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms