Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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