Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms