Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPS29Q9UBQ0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms