Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAPERQ9BY12 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms