Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms