Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA3Q99758 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms