Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC9Q96Q05 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms