Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms