Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP4Q8N3C7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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