Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKL3Q8IVW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms