Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTF1AQ7RTS3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms