Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP24-1Q3LI83 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP24-1Q3LI83 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms