Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF1Q3BBV0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms