Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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