Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROD1Q13562 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROD1Q13562 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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